Em decorrência da disponibilidade de corpo docente, a Área de Concentração Contabilidade e Controladoria foi estruturada nas seguintes linhas de pesquisa.

Controladoria e Contabilidade Gerencial. Abarca grande campo de pesquisa e desenvolvimento de estudos sobre aspectos de Contabilidade e de suas ferramentas de apoio para planejamento, controle, avaliação de desempenho e tomada de decisão nas mais diferentes formas de entidades.

Contabilidade aplicada para Usuários Externos. Envolve o desenvolvimento de estudos e pesquisas relacionadas aos aspectos de identificação, mensuração e divulgação dos eventos passíveis de contabilização para efeito dos stakeholders externos às entidades.

Mercados Financeiros, de Crédito e de Capitais. Abrange uma gama de estudos e pesquisas voltados para os aspectos conceituais e empíricos dos mercados, bem como a aplicação desses recursos sob a ótica dos respectivos desempenhos empresariais passados e os projetados - para os mercados de bolsa e monetários em geral.

Pesquisa e Ensino da Contabilidade. Campo de estudos que se dedica a desenvolver atividades de pesquisa e ensino da Contabilidade, envolvendo tecnologias e técnicas de ensino, abordagens normativa, positiva, axiomática, semiótica e histórica, bem como de metodologia de pesquisa, história da Contabilidade, da Controladoria, da Perícia Contábil e da Auditoria.

	LABORATÓRIOS FEA / FIPECAFI
	O GECON é um modelo baseado na visão de gestão por resultado econômico e compreende um sistema de informação de Controladoria estruturado dentro de uma concepção "holística”.
	O CMF tem o objetivo de fornecer serviços de informação e promover o intercâmbio de conhecimento e experiências entre profissionais do mercado, pesquisadores e demais interessados em Finanças e Mercado Financeiro.
	Laboratório de Tecnologia e Sistemas de Informação Departamento de contabilidade - FEA/USP.
	Centro de Estudos em Seguros, Previdência e Atuária.
	Centro de Pesquisa em Logística Integrada à Controladoria e Negócios. Dedica-se exclusivamente a consultoria, ensino e pesquisas de pós-graduação na área de Avaliações Estratégicas & Econômico-Financeiras de programas de Supply Chain Management e Logística Integrada.
	O CEG - Centro de Estudos em Governança Corporativa realiza atividades de pesquisa, consultoria e educação continuada em governança corporativa. O CEG possui uma abordagem multi-disciplinar e foi constituído com o objetivo de ser o centro mais avançado de estudos acadêmicos e geração de conteúdo sobre governança corporativa do Brasil
	CEMEC- Centro de Estudo de Mercado de Capitais
	CETEC- Centro de Educação em Tecnologia da Educação Aplicada à Contabilidade.